Sanger法测序的原理 利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物,直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3‘-OH基团,使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止,终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整,使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点,但终止在不同的的核苷酸上,可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段,凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。
测序时间 质粒/纯化后的PCR产物:1.5天 菌液/PCR产物:2天 TA克隆测序:3-4天
测序仪器:3730XL 快速电泳,3小时左右即可达到测序要求 新型液体分离胶使读序长度达1100bp,精确读序达800bp。 新型碱基识别与质量评分软件,提高测序准确性。 电泳温度可达70度,有助于去除二级结构的影响。 高灵敏度提高了测序模板DNA的浓度适应范围。 良好的温控装置保证片段分析准确性及重现性良好。 毛细管内荧光检测,灵敏度高。 双光束双侧激光激发,荧光信号强度高度均一。
测序样品的要求: 1.未纯化的PCR原液 片断通常大于200bp; 提供浓度大于50ng/ul,体积大于50ul; 2ul电泳检测条带清晰无杂带。 2.已纯化的PCR PCR产物溶于超纯水中; 浓度大于50ng/ul,体积大于20ul; 电泳检测条带单一。 3.质粒要求 质粒浓度大于100ng/ul,体积大于20ul; 建议使用相关试剂盒提取; 建议同时提供1ml菌液; 大质粒需要注明载体长度。 4.菌液模板要求 说明载体的抗性,我们提供Amp 、kan、chl、tet四种抗生素,Zeocin抗性需要客户提供; 对于低拷贝质粒请直接提供1ug纯化质粒; 提供200ul-1ml左右的过夜培养菌液,加15%灭菌甘油,于离心管中封口保存,防止交叉污染或泄漏; 建议尽量提供穿刺培养的菌种。 5.引物要求 浓度>5pmol/ul,体积大于20ul; 随机引物和兼并引物不适合测序; 尽可能提供引物全序列,PCR退火温度; T7、SP6、M13(+)、M13(-)、T3等通用引物我们免费提供。
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